Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4CQ96DT6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms