Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPUSD4Q96CM3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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