Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMP4CQ96CF2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms