Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms