Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms