Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APH1AQ96BI3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms