Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD2Q969F2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD2Q969F2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms