Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms