Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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