Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TTC9CQ8N5M4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC9CQ8N5M4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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