Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLD3Q8IV08 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PLD3Q8IV08 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms