Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC84Q86UT8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms