Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms