Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGNBQ7Z5D8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGNBQ7Z5D8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGNBQ7Z5D8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGNBQ7Z5D8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGNBQ7Z5D8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGNBQ7Z5D8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGNBQ7Z5D8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NANOGNBQ7Z5D8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms