Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC80Q76M96 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms