Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms