Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CASC2Q6XLA1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms