Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC27Q6UX04 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms