Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms