Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT80Q6KB66 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms