Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARMIL2Q6F5E8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARMIL2Q6F5E8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms