Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INTS3Q68E01 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms