Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIF1Q5UIP0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms