Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms