Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDLIM3Q53GG5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDLIM3Q53GG5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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