Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms