Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms