Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC25A52Q3SY17 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms