Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF8Q3BBV2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF8Q3BBV2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms