Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UVSSAQ2YD98 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UVSSAQ2YD98 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UVSSAQ2YD98 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UVSSAQ2YD98 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UVSSAQ2YD98 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UVSSAQ2YD98 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms