Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDKN3Q16667 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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