Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZIC1Q15915 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZIC1Q15915 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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