Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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