Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA6Q15825 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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