Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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SIX1Q15475 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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SIX1Q15475 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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SIX1Q15475 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SIX1Q15475 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SIX1Q15475 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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