Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms