Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSPNQ14714 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSPNQ14714 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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