Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2H3Q13889 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms