Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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SP140Q13342 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SP140Q13342 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SP140Q13342 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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SP140Q13342 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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