Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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IFT88Q13099 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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IFT88Q13099 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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IFT88Q13099 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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