Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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TRAF1Q13077 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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TRAF1Q13077 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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TRAF1Q13077 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF1Q13077 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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