Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN1Q12860 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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