Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms