Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACVR1Q04771 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACVR1Q04771 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACVR1Q04771 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACVR1Q04771 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACVR1Q04771 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACVR1Q04771 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ACVR1Q04771 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACVR1Q04771 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms