Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OC90Q02509 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
OC90Q02509 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
OC90Q02509 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OC90Q02509 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OC90Q02509 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms