Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms