Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms