Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRCDQ00LT1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms