Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM3AP98173 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FAM3AP98173 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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FAM3AP98173 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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FAM3AP98173 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FAM3AP98173 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FAM3AP98173 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FAM3AP98173 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FAM3AP98173 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FAM3AP98173 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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FAM3AP98173 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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FAM3AP98173 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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FAM3AP98173 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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FAM3AP98173 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM3AP98173 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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