Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms